整个寺庙气势恢宏，建有建有仁王殿、大雄宝殿、东西配殿、钟鼓楼、转轮藏等，可分别供奉门神哼哈二将、释迦牟尼佛、阿弥陀佛和药师佛、十六罗汉等。从大殿出来可到不二法门广场。
    不二法门广场的“不二法门”是一个由大型唐代风格六楼、建筑、群像雕塑、经幢、石刻、浮雕、园林组成的景点。这里的每个小品与建筑都体现出佛家思想精髓——“不二”理念。不二法门广场被高大的的木棉树和鲜红的木棉花簇拥着，广场里建须弥山，须弥山住有众多护法天神。绕过须弥山，便进入“圆通经幢”，其四周是“天龙八部”群像雕塑。由经幢前行，便见“天女散花”石刻，石刻之后是一尊高大的“达摩面壁”浮雕。达摩在嵩山少林面壁九年，被尊为西天禅宗第２８祖、中国禅宗初祖．
    不二法门广场下到曲桥，还有“八宝莲池” 、“耳根圆通”石刻、古色古香吉祥钟亭、观音阁等。
    观音阁阁上安放一尊金碧辉煌的金玉观音，高3.8米，造价约人民币1.9亿元。这里是寺内唯一再要收门票的地方。
    南山寺很大，景点繁多，需花一天的时间游玩。你可以在这里充分感受浓厚的佛教文化气息。
相关历史：
    据说1200年前，鉴真大师偕日本留学僧荣睿、普照及鉴真徒弟等15人第五次东渡日本，遭遇台风后船漂到南山湾，从宁远河口登岸，并在崖城驻留一年多，在此期间修建佛殿，讲经渡人。后来鉴真大师第六次东渡日本获得成功，因此称颂南山为吉祥之地。南山寺选此佳址而建，名山、名寺、名僧长相辉映，使这里成为海南的第一大福地。
南山寺的一些忌讳：
1、 拍照最好不要跟佛像一起拍，即使拍的话，也不要让佛像在自己的正上方。
2、 遇到和尚，可以打招呼，他们可能还礼也可能不还礼，不要见怪，因为僧人是出家人，不太在意平常礼节的。
3、 寺院一般是左进右出的。
4、 烧香拜四方神佛的时候，一点要先面向离你最近的大佛。